对其他系统无法测量的区域进行测序
您会选择一项强大的技术以找出导致序列失败的可能原因吗?
尽管可以调查出导致序列失败的可能原因,但是很多情况下无法这样做。调查问题总会让人困惑、令人沮丧且耗费时间。最好的解决办法是从一开始就采用优质的技术来提高实验室的性能。主动出击才能掌控未来。
对其他系统无法测量的区域进行测序
Sanger 测序仪(GenomeLab GeXP Genetic Analysis System, 后称GeXP)采用独特的脱氧核糖核酸(DNA)测序试剂- 包括线性聚丙烯酰胺(LPA) 凝胶、涂层毛细管、脱氧鸟苷三磷 酸(dITP) 化学试剂、脱氧鸟苷三磷酸(dGTP) 化学和花青(近)红外染料- 以及在线 变性功能。这样可以减少修改,提供更有意义的原始数据,实现更高质量的最终分析。 因此,GeXP 能够解决其他系统无法解决的复杂序列问题,以高质量的序列填补缺口。
在本例中,我们将GeXP 系列与另一个自动测序系统进行比较,对比两款系统在完成 一个棘手的人类基因组序列区中的表现。另一个系统无法解决的一段序列通过GeXP 系统的创新化学反应得以完成。
通过末端标记循环测序(DTCS) 确定基因组串联重复序列
末端标记循环测序
GeXP™ 是一款基于全自动毛细管电泳技术具有基因分析功能的仪器。这款系统通常能 在30 分钟之内完成200 个核苷酸测序,在50 分钟之内完成600 个核苷酸测序,并 且在读取长度超过800 个碱基对的序列时,准确度达到98% 以上。
GeXP 在此过程中采用末端标记循环测序法。循环测序法利用热循环仪内一轮轮的变 性、退火和延伸实现对延伸产物的线性扩增。这些测序方法非常强大,需要的模板数 量远远低于单一温度方法所需的数量。
利用染料末端标记,四个双脱氧终止子均使用不同的荧光染料标记。生长链同时终止 且采用与其碱基对应的染料进行标记。借助这种方法,您可以使用未标记的引物,在 同一个管内完成所有反应,在同一个毛细管内对四种颜色进行评估,且由于没有染料 标记,假停止不会被发现。
自动碱基识别
GenomeLab™ 序列分析软件会自动识别每个碱基并对每次识别指定一个置信度值,便 于您立即评估序列数据的质量。
序列分析包括信号处理、碱基识别和确定各个已识别碱基的置信度值。无需通过校准 补偿光谱重叠或染料间的流动性差异。双通道碱基识别系统首先会找出有效峰值,然 后运用靶向图技术来优化识别的碱基序列。最后,估算识别的碱基的出错概率,并确 定质量值。
自动杂合子检测
确定杂合子碱基在基因组DNA 中的位置对于定位二倍体生物中的突变或多态性具有 重要的实用价值。DNA 测序是最终确认在一个单核苷酸位置是否存在不止一种碱基。
GenomeLab 软件允许用户从序列分析参数编辑器切换到自动杂合子检测。
运用国际生化学会IUB 标准命名法自动检测和确定杂合子。这种机制可以快速突出序 列数据内的多态性或突变。
运用GenomeLab 控制和分析软件自动确定多种杂合子
自动修剪
注意- 基于匹配用户输入序列信息(基于序列的修剪)或根据质量值(基于质量的修 剪)执行修剪功能。
多种分析功能
对于所有研究人员而言,这种技术都是一种理想的分析技术,可以帮助您达成目标。 让我们演示我们的技术如何帮助您,立即请求样品分析。