高度灵敏、多重定量且可重复的基因表达,仅需少量珍贵核糖核酸 (RNA) 样品
如何检测出一次反应中多达 30 种基因且0.5 倍数的微小基因表达变化?
无论您从事干细胞多能性研究、癌症研究、多种呼吸道病毒鉴定,还是食品和饮料中细菌与酵母的表征,都曾面临这样的挑战:如何一次性且只使用少量样本即可确定若干基因的基因表达中微小的变化。
现在,您可以使用 Sanger测序仪(GenomeLab GeXP Genetic Analysis System, 后称GeXP),运用多重反转录聚合酶链式反应法 (XP-PCR*) 进行分析。XP-PCR 允许您快速有效地研究多重基因集合的表达,且与基于多重荧光定量聚合酶链反应 (q PCR*) 方法相比,灵敏度更高、速度更快且经济效益更优。
GeXP™可以准确检测出基因表达中低至 0.5 倍数的变化,从而提供更精确的信息。XP-PCR* 基于我们特有的通用引物方案,允许对单孔中多个参照基因、目的基因和内部质控进行客观分析。这样可以实现准确的标准化,可靠检测出基因表达中非常细小的变化。
GeXP 是多重基因验证和通路研究的理想选择。重点应用领域包括干细胞多能性研究1、基于福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 样品的癌症研究。2、呼吸道病毒鉴定中的多重微生物检测。3、食品和饮料细菌与酵母表征。对于已经借助文献资料或大规模筛查技术完成初步发现工作的研究人员,GeXP 同样可以提供支持。GeXP 系统用于多重定量基因表达分析,也可作为多功能遗传分析平台。
基因表达解决方案的优点
- 高通量定量基因表达 - 每次反应可以分析多达 30 种基因,可扩展的 GeXP 能够在无人看管的情况下在 24 小时内完成多达5760个数据点的检查。
- 省时且经济有效的基因表达 - GeXP 具有多重PCR产物分析的功能,能够在单个样品分析 30 种基因,显著降低了基因表达结果的平均成本且节省了大量时间。
- 值得信赖的高准确度和重现性 - 凭借准确的线性度(对于大多数基因,R2 > 0.99),GeXP 可以检测出小至 0.5 倍数的基因表达变化,进而提供精准的基因表达谱。高信噪比增加了分析不同样品时的灵敏度和重现性,从而获得准确和祥实的结果。
- 准确表达目标基因 - 不要假设 PCR 反应扩增产物就是预期目标。选择性和假基因转录产物也会通过同源引物序列扩增。利用毛细管电泳按照大小分离 PCR 产物,不论特定还是非特定,您都能从定量中鉴定和清除非预期产物,从而实现 对特定预期基因目标的高度准确且精准的定量。这是 GeXP 基因表达谱 (XP-PCR) 过程为多重反转录聚合酶链反应法和毛细管电泳技术带来的优势。这样一来,您可以在多重环境中获得准确的量化。
- 样品要求低 - 只需 5-50ng 的 RNA,就可以有效地运用多重扩增的能力和毛细管电泳读数检查明确的基因组。
- 综合性软件工具 - GeXP 拥有一套先进的软件工具,从仪器控制到高通量基因表达研究的数据管理,为您提供全程指导。
多重基因表达交付高灵敏度、高准确度和高精确度结果
- 线性度和精确度 - GeXP 可以生成具有良好线性关系的基因表达数据。在一个多重反应中针对每种基因生成 RNA 数量与基因表达水平之间的高度线性相关性,平均相关系数 (R2) 高于 0.99。
- 准确度 - GeXP 具有足够高的灵敏度,甚至可以精确检测出基因表达中的微小变化。GeXP 能够一致且准确地为多重实验中的基因定量 RNA 浓度 0.5 倍的增加。
- 人乳腺癌电泳图谱 - 同时分析与乳腺肿瘤发展相关的 24 种功能基因以及三种参照(管家)基因。
干细胞分析解决方案 - 完整的干细胞表征
针对干细胞筛选工作流程相关的挑战, GeXP在单个平台上提供了一整套解决方案。这套系统集成了具有基因表征功能的 GeXP 启动试剂、多重引物试剂和具有污染物检测功能的 GeXP人微卫星检测试剂盒,可以加快对多功能干细胞系进行筛查的速度。结合 SCIEX专职技术专家的支持, GeXP令研究和质量控制过程更有成效和效率,省时又省钱。
产品特点
GeXP 基因表达谱与片段分析
- 利用毛细管电泳可靠性的单平台综合解决方案,仅需一种毛细管、一种凝胶和一款软件,提升效率
- 每天检测超过 5700 个数据点且无需人员看守,每次反应可实现对 2-30 种基因高度准确的相对定量
- 每次反应仅需使用 5 到 50ng 的总 RNA,有效克服 RNA 量的限制
- 适用于生物标记物标记验证和后续筛查,以及独特又充满挑战性的样品,例如诱导多能干细胞 (iPSC) 集落、单细胞溶液和同时检测多个转录变异体
含有多套引物的启动试剂盒
- 在分子水平上监测和表征细胞系,灵敏度和特异性高
- 比较重编程因子的表达情况
- 针对体细胞重编程和特定谱系分化的每一个步骤表征生物标记物
- 轻而易举地识别和评估非诱导细胞系中单独集落的多能性
- 监测干细胞系的多能性
- 利用通用扩增引物标签消除对引物的单独标记
GGeXP 人微卫星引物试剂盒(RUO)
- 从分化到多能状态再返回分化状态,在整个过程跟踪细胞系,增加对数据源的信心 - 监测和定量污染物
- 利用 12 个基因位点鉴定和跟踪人体细胞系,涵盖从分化到 iPSC(诱导性多能干细胞) 到再分化的过程
新一代多能性生物标记物筛选
- 利用借助通用 PCR引物方案提供多重扩增能力,使单个系统加速过程,节省时间
- 利用 GeXP 启动试剂盒集成的染料标记引物减少引物合成
- 每次反应和相对定量可分析多达 30 种基因,具有很高的灵敏度和重现性
客户服务和支持
- 借助在线、现场和电话等多种方式获得技术和应用支持
- 现场安装和仪器系统及使用方法培训
- 可以依赖的完整售后硬件、软件和方法支持
对于研究人员而言,这种技术都是一种理想的分析技术,可以帮助您达成目标。让我们演示我们的技术如何帮助您,立即请求样品分析。